Singleplex 遺伝⼦解析⽤標準サンプル
HorionのSinglePlex標準サンプルはFFPEまたはgRNAフォーマットで提供されます。患者サンプル由来の標準サンプルに付随する変動性が無く、独自の細胞株混合物の調達、特性評価、およびその記録保存等の煩わしさを回避することができます。qPCR、サンガーシーケンシング、NGSなどの幅広いアッセイに適用できます。
特徴
- 細胞株由来の標準サンプル
- gDNA：対応するWild Typeの標準サンプルで希釈し、任意のアレル頻度に調整することで、検出限界の検証が可能
- FFPE：穏やかな固定と均質なパラフィン包埋法は、再現性の高いFFPE切片を提供
- 期待される抽出可能なDNA量＊：≧400ng
＊ FFPE 1切片あたりのDNA収量はPromega社のMaxwell LEVPlus FFPE DNA Extraction kitを使用時
アプリケーション
- 解析法の感度/特異度の評価
- 研究/開発中のがんパネル遺伝子検査の最適化、検証、または測定性能モニタリング
- FFPEフォーマットでは、DNA抽出からインフォマティクス解析まで、解析プロセス全体の評価が可能
| 製品カテゴリ | フォーマット | 容量 | 濃度 |
|---|---|---|---|
| gDNA Variant | gDNA | 1 µg | 50ng/µl |
| gDNA Wild Type | gDNA | 5 µg | 50ng/µl |
| FFPE DNA | FFPE | 1 切片 | – |
FFPEフォーマット
| Gene | AA Change＊ | AF(%) | 製品番号 | Gene | AA Change＊ | AF(%) | 製品番号 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AKT1 | Wild Type | – | HD172 | K-Ras | A59T | 50% | HD715 | |
| B-Raf | V600E | 1% | HD273 | K-Ras | G12A | 5% | HD117 | |
| B-Raf | V600E | 5% | HD705 | K-Ras | G12A | 50% | HD255 | |
| B-Raf | V600E | 20% | HD232 | K-Ras | G12C | 50% | HD256 | |
| B-Raf | V600E | 50% | HD598 | K-Ras | G12D | 5% | HD119 | |
| B-Raf | V600K | 1% | HD274 | K-Ras | G12D | 50% | HD204 | |
| B-Raf | V600K | 5% | HD123 | K-Ras | G12R | 50% | HD207 | |
| B-Raf | V600K | 50% | HD268 | K-Ras | G12S | 50% | HD210 | |
| B-Raf | V600R | 50% | HD275 | K-Ras | G12V | 50% | HD213 | |
| B-Raf | Wild Type | – | HD266 | K-Ras | G13D | 5% | HD113 | |
| EGFR | G719A | 50% | HD747 | K-Ras | G13D | 50% | HD216 | |
| EGFR | G719S | 5% | HD714 | K-Ras | Q61H | 50% | HD94 | |
| EGFR | G719S | 50% | HD230 | K-Ras | Q61L | 50% | HD140 | |
| EGFR | L858R | 5% | HD129 | K-Ras | Wild Type | – | HD135 | |
| EGFR | L858R | 20% | HD130 | N-Ras | G12D | 50% | HD745 | |
| EGFR | L858R | 50% | HD131 | N-Ras | Q61R | 50% | HD286 | |
| EGFR | L861Q | 5% | HD132 | N-Ras | Wild Type | – | HD322 | |
| EGFR | L861Q | 50% | HD133 | PIK3CA | E542K | 50% | HD121 | |
| EGFR | S768I | 50% | HD707 | PIK3CA | E545K | 50% | HD112 | |
| EGFR | T790M | 5% | HD125 | PIK3CA | H1047R | 50% | HD599 | |
| EGFR | T790M | 20% | HD126 | PIK3CA | Wild Type | – | HD320 | |
| EGFR | T790M | 50% | HD127 | |||||
| EGFR | V769_D770insAS | 50% | HD706 | |||||
| EGFR | Wild Type | – | HD141 | |||||
| EGFR | ΔE746_A750 | 50% | HD308 | |||||
| EGFR | ΔE746-A750 | 5% | HD653 |
＊ Amino Acid Change
gDNAフォーマット
| Gene | AA Change＊ | AF(%) | 製品番号 | Gene | AA Change＊ | AF(%) | 製品番号 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| B-Raf | V600E | 50% | HD238 | JAK2 | V617F | 50% | HD649 | |
| B-Raf | Wild Type | – | HD249 | JAK2 | Wild Type | – | HD652 | |
| EGFR | G719A | 50% | HD262 | K-Ras | G12A | 50% | HD265 | |
| EGFR | L858R | 50% | HD254 | K-Ras | G12C | 50% | HD269 | |
| EGFR | S768I | 50% | HD261 | K-Ras | G12D | 50% | HD272 | |
| EGFR | T790M | 50% | HD258 | K-Ras | G12R | 50% | HD287 | |
| EGFR | V769_D770insASV | 50% | HD260 | K-Ras | G12S | 50% | HD288 | |
| EGFR | Wild Type | – | HD709 | K-Ras | G12V | 50% | HD289 | |
| EGFR | ΔE746-A750 | 50% | HD251 | K-Ras | G13D | 50% | HD290 | |
| EML4/ALK | EML4/ALK Translocation Variant 1 | 50% | HD664 | K-Ras | Wild Type | – | HD710 | |
| FLT3 | D835Y | 50% | HD668 | N-Ras | Wild Type | – | HD648 | |
| FLT3 | Wild Type | – | HD669 | PIK3CA | E542K | 50% | HD688 | |
| IDH1 | R132H | 50% | HD677 | PIK3CA | E545K | 50% | HD689 | |
| IDH1 | Wild Type | – | HD678 | PIK3CA | H1047R | 50% | HD690 | |
| IDH2 | R172K | 50% | HD680 | PIK3CA | Wild Type | – | HD691 | |
| IDH2 | Wild Type | – | HD681 |
＊ Amino Acid Change