siRNA ライブラリー
siRNAライブラリーは、デザイン済みsiRNAをプレートに分注した製品です。各siRNAをそれぞれ細胞に導入し、表現型の変化を検出することで、生命現象のプロセスに関与する遺伝子を迅速に同定することができます。siRNAライブラリーを使ったsiRNAスクリーニングは、細胞内パスウェイの解析・遺伝子の機能解析・創薬ターゲット分子の探索などで活用されています。
siRNAスクリーニング文献情報（日本語/英語）
特長
組み合わせ済コレクションライブラリーとCherry-pickカスタムライブラリーをご用意
遺伝子ファミリーおよびパスウェイごとに分類したコレクションをご用意しています。お客様のユニークな実験に対応するカスタムライブラリーは、Cherry-Pick Library Loaderで遺伝子名やリストをアップロードすることにより簡単にライブラリーを作成しオーダーすることができます。
製品情報
コレクションライブラリー
- デザイン済みsiRNAをプレートに分注したライブラリー
- 遺伝子ファミリーおよびパスウェイごとに分類したコレクションライブラリー
- ON-TARGETplus、またはAccell製品タイプをご用意。
- siGENOME、またはLincode製品タイプでライブラリーをご希望の場合は、Cherry-pickカスタムライブラリーをご利用ください。
- SMARTpoolあるいはSet of 4フォーマット
コレクションライブラリー（ON-TARGETplus、Accell）
| Human | ||
|---|---|---|
| コレクション | ON-TARGETplus | Accell |
| Apoptosis | 558 | ー |
| Cell cycle regulation | 131 | ー |
| Cytokine receptors | 116 | ー |
| Deubiquitinating enzymes | 98 | ー |
| DNA damage response | 240 | ー |
| Drug targets ＊1 | ～4,700 | ～4,700 |
| Druggable genome ＊2 | ～7,500 | ～7,500 |
| Epigenetics | 463 | ー |
| G Protein-Coupled Receptors (GPCR) | 390 | 390 |
| Ion channels | 349 | 347 |
| Membrane trafficking | 140 | ー |
| Nuclear receptors | 52 | ー |
| Phosphatases | 254 | 257 |
| Proteases | 478 | 480 |
| Protein kinases | 709 | 714 |
| Serine Proteases | ー | ー |
| Transcription Factors | ー | ー |
| Tyrosine kinases | 88 | ー |
| Ubiquitin conjugation subset #1 | 88 | 89 |
| Ubiquitin conjugation subset #2 | 115 | 115 |
| Ubiquitin conjugation subset #3 | 386 | 396 |
| Whole genome | ～18,000 | ー |
| Mouse | ||
|---|---|---|
| コレクション | ON-TARGETplus | Accell |
| Apoptosis | 535 | ー |
| Cell cycle regulation | 128 | ー |
| Cytokine receptors | ー | ー |
| Deubiquitinating enzymes | 126 | ー |
| DNA damage response | ー | ー |
| Drug targets ＊1 | ～5,100 | ー |
| Druggable genome ＊2 | ～6,400 | ー |
| Epigenetics | ー | ー |
| G Protein-Coupled Receptors (GPCR) | 571 | ー |
| Ion channels | 335 | ー |
| Membrane trafficking | ー | ー |
| Nuclear receptors | ー | ー |
| Phosphatases | 220 | ー |
| Proteases | ー | ー |
| Protein kinases | 742 | 652 |
| Serine Proteases | ー | ー |
| Transcription Factors | ー | ー |
| Tyrosine kinases | ー | ー |
| Ubiquitin conjugation subset #1 | 82 | ー |
| Ubiquitin conjugation subset #2 | 109 | ー |
| Ubiquitin conjugation subset #3 | 351 | ー |
| Whole genome | ー | ー |
※ 表中の数字は、各コレクションライブラリーに含まれるsiRNAターゲット遺伝子数を表します。参照データベースの変更等により、遺伝子数や製品構成は変更になる場合があります。
＊1 アポトーシス、老化、DNA修復、オートファジー、核酸結合に関連する遺伝子や核内レセプター遺伝子などをターゲットとするsiRNAをまとめたコレクションです。
＊2 Drug targetコレクションライブラリーに、GPCR、Ion channel、Phoshatase、Protease、Protein kinase、Ubiquitin conjugation subset #1～#3の8つのコレクションライブラリーをプラスした製品です（ただし、Mouse ON-TARGETplus Druggable genomeコレクションライブラリーは、 Drug targetコレクションライブラリーに、GPCRおよびProtein Kinaseの2つのコレクションライブラリーをプラスした製品です）。
Cherry-pick ライブラリー（siRNA）
- お客さまのユニークな実験に対応するカスタムのsiRNAライブラリーを作成するサービスです。
- Cherry-pick Library Loaderを使用して、ヒト・マウス遺伝子をターゲットとするデザイン済みsiRNAを、最少20ウェルから96ウェルプレートにレイアウトできます（384ウェルプレートの場合、最少40ウェルから）。
- 小容量包装のため、コストを抑えたsiRNA実験が可能です。
- 製品形態は凍結乾燥品です。
| 製品 | 製品タイプ | 生物種 | フォーマット | Size |
|---|---|---|---|---|
| Cherry-pickライブラリー
(siRNA) |
siGENOME,
ON-TARGETplus, Accell, Lincode |
Human,
Mouse |
SMARTpool,
1～4個のIndividual |
0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol |
スクリーニング実験の流れ
スクリーニング実験に先立ちアッセイ系の至適化を行います。1次スクリーニングでは、ターゲット遺伝子を確実にノックダウンできるSMARTpoolフォーマット製品が有用です。2次スクリーニングでは、SMARTpoolを使うと同時にSet of 4フォーマット製品を用いてヒットの検証を行います。
関連リンク
【本社サイト】siRNA ライブラリー
Cherry-pick Library Loader
コントロールsiRNA
DharmaFECTトランスフェクション試薬
DharmaFECT 1～4は、細胞にあわせて最適条件で使い分ける4種類の低分子RNA（crRNA、tracrRNAを含む）用トランスフェクション試薬です。