siRNAライブラリーは、デザイン済みsiRNAをプレートに分注した製品です。各siRNAをそれぞれ細胞に導入し、表現型の変化を検出することで、生命現象のプロセスに関与する遺伝子を迅速に同定することができます。siRNAライブラリーを使ったsiRNAスクリーニングは、細胞内パスウェイの解析・遺伝子の機能解析・創薬ターゲット分子の探索などで活用されています。

siRNAスクリーニング文献情報（日本語/英語）

特長

組み合わせ済コレクションライブラリーとCherry-pickカスタムライブラリーをご用意

遺伝子ファミリーおよびパスウェイごとに分類したコレクションをご用意しています。お客様のユニークな実験に対応するカスタムライブラリーは、Cherry-Pick Library Loaderで遺伝子名やリストをアップロードすることにより簡単にライブラリーを作成しオーダーすることができます。

製品情報

コレクションライブラリー

• デザイン済みsiRNAをプレートに分注したライブラリー
• 遺伝子ファミリーおよびパスウェイごとに分類したコレクションライブラリー
• siGENOME、ON-TARGETplus、Accell、Lincode siRNAの4種類の製品ラインアップ
• SMARTpoolあるいはSet of 4フォーマット

 

コレクションライブラリー（siGENOME、ON-TARGETplus、Accell）

Human
コレクション	siGENOME	ON-TARGETplus	Accell
Apoptosis	446	558	ー
Cell cycle regulation	169	131	ー
Cytokine receptors	116	116	ー
Deubiquitinating enzymes	98	98	ー
DNA damage response	240	240	ー
Drug targets ＊1	～4,700	～4,700	～4,700
Druggable genome ＊2	～7,500	～7,500	～7,500
Epigenetics	463	463	ー
G Protein-Coupled Receptors (GPCR)	390	390	390
Ion channels	349	349	347
Membrane trafficking	140	140	ー
Nuclear receptors	52	52	ー
Phosphatases	256	254	257
Proteases	480	478	480
Protein kinases	712	709	714
Serine Proteases	143	ー	ー
Transcription Factors	1,529	ー	ー
Tyrosine kinases	85	88	ー
Ubiquitin conjugation subset #1	89	88	89
Ubiquitin conjugation subset #2	115	115	115
Ubiquitin conjugation subset #3	396	386	396
Whole genome	ー	～18,000	ー

Mouse
コレクション	siGENOME	ON-TARGETplus	Accell
Apoptosis	289	535	ー
Cell cycle regulation	105	128	ー
Cytokine receptors	158	ー	ー
Deubiquitinating enzymes	260	126	ー
DNA damage response	ー	ー	ー
Drug targets ＊1	～7,100	～5,100	ー
Druggable genome ＊2	～10,000	～6,400	ー
Epigenetics	ー	ー	ー
G Protein-Coupled Receptors (GPCR)	515	571	ー
Ion channels	340	335	ー
Membrane trafficking	113	ー	ー
Nuclear receptors	46	ー	ー
Phosphatases	273	220	ー
Proteases	540	ー	ー
Protein kinases	715	742	652
Serine Proteases	123	ー	ー
Transcription Factors	1,440	ー	ー
Tyrosine kinases	85	ー	ー
Ubiquitin conjugation subset #1	80	82	ー
Ubiquitin conjugation subset #2	104	109	ー
Ubiquitin conjugation subset #3	339	351	ー
Whole genome	～19,000	ー	ー

※ 表中の数字は、各コレクションライブラリーに含まれるsiRNAターゲット遺伝子数を表します。参照データベースの変更等により、遺伝子数や製品構成は変更になる場合があります。

^＊1 アポトーシス、老化、DNA修復、オートファジー、核酸結合に関連する遺伝子や核内レセプター遺伝子などをターゲットとするsiRNAをまとめたコレクションです。

^＊2 Drug targetコレクションライブラリーに、GPCR、Ion channel、Phoshatase、Protease、Protein kinase、Ubiquitin conjugation subset #1～#3の8つのコレクションライブラリーをプラスした製品です（ただし、Mouse ON-TARGETplus Druggable genomeコレクションライブラリーは、 Drug targetコレクションライブラリーに、GPCRおよびProtein Kinaseの2つのコレクションライブラリーをプラスした製品です）。

コレクションライブラリー（Lincode）

製品	生物種	遺伝子数	フォーマット	Size
Lincode siRNA Library – NR lncRNA RefSeq v65	Human	3,430	SMARTpool / Set of 4	0.1, 0.25, 0.5 nmol
Lincode siRNA Library – NR lncRNA RefSeq v65	Mouse	1,997	SMARTpool / Set of 4	0.1, 0.25, 0.5 nmol

※ NCBI RefSeqのバージョンおよびターゲット遺伝子数は変更になる場合があります。

 

Cherry-pick ライブラリー（siRNA）

• お客さまのユニークな実験に対応するカスタムのsiRNAライブラリーを作成するサービスです。
• Cherry-pick Library Loaderを使用して、ヒト・マウス遺伝子をターゲットとするデザイン済みsiRNAを、最少20ウェルから96ウェルプレートにレイアウトできます（384ウェルプレートの場合、最少40ウェルから）。
• 小容量包装のため、コストを抑えたsiRNA実験が可能です。
• 製品形態は凍結乾燥品です。

 

製品	製品タイプ	生物種	フォーマット	Size
Cherry-pickライブラリー (siRNA)	siGENOME, ON-TARGETplus, Accell, Lincode	Human, Mouse	SMARTpool, 1～4個のIndividual	0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol

 

スクリーニング実験の流れ

スクリーニング実験に先立ちアッセイ系の至適化を行います。1次スクリーニングでは、ターゲット遺伝子を確実にノックダウンできるSMARTpoolフォーマット製品が有用です。2次スクリーニングでは、SMARTpoolを使うと同時にSet of 4フォーマット製品を用いてヒットの検証を行います。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

関連リンク

【本社サイト】siRNA ライブラリー

Cherry-pick Library Loader

コントロールsiRNA

DharmaFECTトランスフェクション試薬

DharmaFECT 1～4は、細胞にあわせて最適条件で使い分ける4種類の低分子RNA（crRNA、tracrRNAを含む）用トランスフェクション試薬です。

バッファー・水・細胞培養液

各種資料 / 情報

siRNA/microRNA試薬再溶解プロトコル（プレート用）

Guidelines and Recommendations for Dharmacon siRNA Libraries（英語）