Cherry pickクローンライブラリー
ベクターベースの試薬のライブラリーをデザインおよび注文
- Horizonのオンラインツールは、クローンを選択し、独自の実験ニーズに合わせてライブラリーを構成できるフレキシビリティがあります。
- Dharmacon™ shRNAまたはEdit-R™ CRISPR sgRNAのアルゴリズムにより最適化されたデザイン済みレンチウイルス製品ラインから、または汎用されている哺乳類cDNAまたはORF遺伝子発現コレクションから、ベクターベースの試薬を選択できます。大腸菌グリセロールストックをご用意しています。
- 化学合成試薬については、Cherry-pick化学合成試薬ライブラリーを参照してください。
- 遺伝子あたり、特定のクローンを選択するか、利用可能なすべてのクローンを選択します。
- クローンは、自動的に、抗生物質耐性マーカーまたは試薬フォーマットにより異なるプレートに分けられます。
Cherry-Pick Custom Library Tool
概要
Horizonの組合せ済みsgRNA、shRNA、または過剰発現ライブラリーが実験要件に合わない場合、Cherry-Pick Custom Library Toolを使用して、簡便に、迅速に、経済的に独自のカスタムクローンライブラリーを作成できます。
大腸菌グリセロールストックフォーマットのsgRNA、shRNA、およびヒトおよびマウス試薬用の哺乳類過剰発現試薬からピックアップして、特定のニーズに最適なクローンコレクションを作成できます。
Cherry-pickライブラリー作成概要:
- 目的製品の遺伝子識別子をロード
-
- NCBI遺伝子IDまたは遺伝子記号
- ライブラリー試薬カタログ番号
-
- 試薬の種類を選択します。
- 表示結果が希望と一致しているか、および製品作成可否を確認します。
- プレートに含める試薬と試薬フォーマットを選択します。
- カートに追加し、通常製品と同様に購入手順を進めてください
約4分半のビデオでCherry-Pick Custom Library Toolの使い方をご説明しています。
ライブラリーオプション
Cherry-Pick Custom Library Toolを使用して、これらの試薬を96ウェルプレートでご注文可能です。
| sgRNA | Edit-R Lentiviral sgRNA |
| shRNA | GIPZ, TRIPZ, TRC |
| 過剰発現試薬 | Mammalian Genome Collection (MGC), Precision LentiORFs, CCSB-Broad Lentiviral Expression Library, ORFeome Collaboration Collection, Human ORFeome v8.1 Library, CCSB Human ORFeome |
| フォーマット | 大腸菌グリセロールストック |
| 生物種 | ヒトまたはマウス |
| プレートタイプ | 96ウェル。同一試薬で最少20ウェルから |
製品ラインの選択
shRNA製品ラインの選択
Horizonは、ヒトおよびマウスのゲノム全体にわたる3種類のデザイン済み製品ラインを提供しています。以下の表を参照し、用途に適したshRNA製品ラインを選択してください。
| GIPZ | TRIPZ | TRC | |
|---|---|---|---|
| 生物種 | ヒト、マウス | ヒト | ヒト、マウス |
| プロモーター | Human CMV (Pol II) | TRE min-CMV | U6 (Pol II) |
| ヘアピンフォーマット | microRNAベースshRNA | microRNAベースshRNA | シンプルヘアピン型shRNA |
| 蛍光レポーター | TurboGFP | TurboRFP | – |
| 誘導性発現 | – | ● | – |
過剰発現試薬の選択
Horizonは、5種類の異なる哺乳類のORF（open reading frame）コレクションとMGC（Mammalian Genome Collection）cDNAコレクションをご提供しています。以下の表を参照し、用途に適した過剰発現試薬ラインを選択してください。
| Mammalian Genome Collection (MGC) | Precision LentiORF | CCSB-Broad Lentiviral Expression ORF | ORFeome Collaboration Collection | Human ORFeome V8.1 | CCSB Human ORFeome | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| フォーマット | cDNA | ORF | ORF | ORF | ORF | ORF |
| 生物種 | ヒト、マウス | ヒト | ヒト | ヒト、マウス | ヒト | Human |
| シーケンス解析 | ● | ● | ● | ● | ● | No |
| Expression ready | 一部 | ● | ● | – | – | No |
| サブクローニング方法 | Restriction digest | – | – | Gateway® | Gateway® | Gateway® |
| 選択マーカー | – | GFP | V5 epitope tag | – | – | N/A |
試薬の選択
すべての試薬は、96ウェルプレートにアレイ化された大腸菌グリセロールストックとしてお届けします。
sgRNAクローン
遺伝子あたり最大4つのsgRNAコンストラクトを含むデザイン済みEdit-R Human Lentiviral sgRNA Druggable Genomeコレクションから選択することができます。最少20～コンストラクト／注文。遺伝子ごとに3〜4個のコンストラクトを選択することをお勧めします。
shRNAクローン
GIPZ、TRIPZ、またはTRCレンチウイルスshRNAコレクションのから選択することができます。最少20～コンストラクト／注文。遺伝子ごとに3〜5個のコンストラクトを選択することをお勧めします。
過剰発現クローン
MGCコレクション：他のコレクションと混合することはできません。最少20～コンストラクト／注文。抗生物質の要件に従ってクローンをプレーティングされます。
ORFコレクション
他のORFコレクションと組み合わせて、目的のライブラリーのカバレッジを増やすことができます。1つのコレクションから最少20～コンストラクト／注文。クローンはコレクションごとにプレーティングされます。