CRISPRスクリーニングライブラリー
プール化（pooled）sgRNAまたはアレイ化（arrayed）crRNAによってハイスループットゲノム編集実験が可能となります。
アレイ化（arrayed）crRNAは、マルチパラメーターの表現型解析、ハイコンテント表現型解析や形態学的またはレポーターアッセイなどを含むシングルウェルで行う様々な表現型アッセイを可能にします。
機能喪失スクリーニングは、遺伝子機能および相互作用を発見するための強力な順遺伝的アプローチです。多数のターゲット遺伝子に対応した多種類のsgRNA発現用レンチウイルス粒子を混合したプール化sgRNAライブラリーは、DNAレベルで数百、数千の遺伝子をノックアウトする機能喪失スクリーニングを、NGSを用いることによって大規模なインフラを必要とせずに簡素化しました。
概要
豊富な組み合わせ済ライブラリーとカスタムライブラリー
遺伝子ファミリー全体、Druggable、または生物学的パスウェイ研究用の組み合わせ済ライブラリーをご用意しています。カスタムライブラリーはCherry-Pick library toolで遺伝子名やリストをアップロードすることにより簡単にライブラリーを作成しオーダーすることができます。
遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いCRISPR-Cas9ライブラリー
アレイ化およびプール化ライブラリーはいずれも、Horizonのアルゴリズム（Edit-R algorithm）による遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みガイドRNAでライブラリー化されています。
製品情報
Edit-R synthetic sgRNA (化学合成sgRNA)ライブラリー
- シングルガイドフォーマットで、複雑でゲノム編集が難しい細胞タイプに適しています。
- デザインアルゴリズムは、タンパク質の機能的なノックアウトの可能性を最大化すると同時に、厳密な特異性チェックによりオフターゲット編集を最小限に抑えます。ヌクレアーゼ耐性を改善するために化学修飾がされています。
- 信頼性の高い表現型解析のために、遺伝子ごとに3つのユニークなsgRNAデザインがプールされています。
- 遺伝子ファミリーコレクションが、96または384ウェルプレートで提供されます。
- 包装容量は1、0.25、0.5、1.0 nmol から選択可能です。
- 製品形態は凍結乾燥品です。
| ヒト | |
|---|---|
| 製品 | 遺伝子数＊ |
| Whole Genome | 19037 |
| Druggable Genome | 8340 |
| GPCRs | 390 |
| Ion Channels | 417 |
| Phosphatases | 256 |
| Proteases | 527 |
| Protein Kinases | 746 |
| Ubiquitin Enzymes | 738 |
| Transcription Factors | 1580 |
| Drug Targets | 3686 |
＊ 参照するデータベースにより予告なく変更になる場合があります。
Cherry-Pick synthetic sgRNAライブラリー
お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みEdit-R synthetic sgRNA (化学合成sgRNA)を、96あるいは384ウェルプレートに分注してお届けするサービスです。
- Cherry-pick library toolは、お客様独自の実験ニーズに合わせてフレキシブルにライブラリーを構築し、プレートレイアウトをカスタマイズできます。
- ご希望のウェルにコントロールを追加できます。
- 遺伝子あたり3種類のデザイン済みsynthetic sgRNAを混合したPoolフォーマットと、1配列毎に分注したIndividualフォーマットがあります。Individualフォーマットは1遺伝子につき1～3配列から選択できます。
- 最低注文数：20ウェル分の製品（96ウェルプレートの場合）、40ウェル分の製品（384ウェルプレートの場合）
- 製品形態は凍結乾燥品です。
| 製品 | 生物種 | Size |
|---|---|---|
| Pool: Edit-R synthetic sgRNA Cherry-pick Library（3配列の混合物/ウェル） | Human | 0.1, 0.25, 0.5, 1.0 nmol
（1 poolあたり） |
| Individual: Edit-R synthetic sgRNA Cherry-pick Library（1配列/ウェル） | 0.1, 0.25, 0.5, 1.0 nmol
（1 配列あたり） |
Edit-R CRISPR (knockout) crRNAライブラリー
より堅牢で信頼性の高い遺伝子ノックアウトのために、Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) crRNA（化学合成品）から選択されています。アレイ化ライブラリーフォーマットは、ハイコンテント表現型解析や形態学的またはレポーターアッセイなど、シングルウェルで行う様々な表現型アッセイを可能にします。
- ヒト・マウス用のデザイン済みcrRNAを、遺伝子ファミリーやパスウェイごとに分類して96あるいは384ウェルプレートに分注した製品です。
- 遺伝子あたり4種類のデザイン済みcrRNAを混合したPoolフォーマットと、4種類をセットにしたSet of 4フォーマットをご用意しています。
- 包装容量は0.1、0.25、0.5 nmol から選択可能です。
- 製品形態は凍結乾燥品です。
| ヒト | マウス | |
|---|---|---|
| 製品 | 遺伝子数＊1 | 遺伝子数＊1 |
| Edit-R – Cell Cycle Regulation | 169 | 105 |
| Edit-R – Cytokine Receptors | 110 | 139 |
| Edit-R – Deubiquitinating Enzymes | 94 | 100 |
| Edit-R – DNA Damage Response | 240 | ー |
| Edit-R – Drug Targets | 3,686 | ー |
| Edit-R – Druggable Genome＊2 | 8,422 | ー |
| Edit-R – Epigenetics | 835 | 724 |
| Edit-R – G Protein-coupled Receptors | 390 | 515 |
| Edit-R – Genome | 19,127 | ー |
| Edit-R – Ion channels | 417 | 340 |
| Edit-R – Membrane Trafficking | 140 | 113 |
| Edit-R – Nuclear Receptors | 52 | 46 |
| Edit-R – Phosphatases | 248 | 273 |
| Edit-R – Proteases | 527 | 599 |
| Edit-R – Protein Kinases | 746 | 774 |
| Edit-R – Transcription Factors | 1,580 | 1,419 |
| Edit-R – Tyrosine Kinases | 90 | 92 |
| Edit-R – Ubiquitin Enzymes | 738 | 752 |
＊1 参照するデータベースにより予告なく変更になる場合があります。
＊2 Proteases、Protein Kinases、Phosphatases、Transcription Factors、Ubiquitin Enzymes、GPCRs、Ion Channels、Drug Target各ライブラリーをセットとした製品です。
Cherry-Pick CRISPR (knockout) crRNA Library
お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) crRNAを、96あるいは384ウェルプレートに分注してお届けするサービスです。
- Cherry-pick library toolは、お客様独自の実験ニーズに合わせてフレキシブルにライブラリーを選択し、プレートレイアウトをカスタマイズできます。
- ご希望のウェルにコントロールを追加できます。
- 遺伝子あたり4種類のデザイン済みcrRNAを混合したPoolフォーマットと、1配列毎に分注したIndividualフォーマットがあります。Individualフォーマットは1遺伝子につき1～５配列から選択できます。
- 最低注文数：20ウェル分の製品（96ウェルプレートの場合）、40ウェル分の製品（384ウェルプレートの場合）
- 製品形態は凍結乾燥品です。
| 製品 | 生物種 | Size |
|---|---|---|
| Pool: Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Cherry-pick Library
（4配列の混合物/ウェル） |
Human, Mouse |
0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol
（1 poolあたり） |
| Individual: Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Cherry-pick Library（1配列/ウェル） | 0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol
（1 配列あたり） |
Edit-R Arrayed Lentiviral sgRNA Library
- Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) sgRNAから選択されています。
- デザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAベクターを導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えた溶液を、遺伝子ファミリーやパスウェイごとに分類して96ウェルプレートに分注した製品です。
- 遺伝子あたり4種類のデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAをご用意しています。
- ヒト用のみです。
| ヒト | |
|---|---|
| 製品 | 遺伝子数＊ |
| Edit-R – Druggable Genome | 7,826 |
| Edit-R – Drug Targets | 3,737 |
| Edit-R – G Protein-coupled Receptors | 381 |
| Edit-R – Ion channels | 348 |
| Edit-R – Phosphatases | 253 |
| Edit-R – Proteases | 478 |
| Edit-R – Protein Kinases | 698 |
| Edit-R – Transcription Factors | 1,507 |
| Edit-R – Ubiquitin Conjugation | 583 |
＊ 参照する遺伝子データベースにより予告なく変更になる場合があります。
Cherry-Pick CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNA Clone Library
お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAベクター導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えた溶液を、96ウェルプレートに分注してお届けするサービスです。
- Cherry-pick library toolは、お客様独自の実験ニーズに合わせてフレキシブルにライブラリーを選択し、プレートレイアウトをカスタマイズできます。
- ご希望のウェルにコントロールを追加できます。
- 最低注文数：20ウェル分の製品
- 製品形態は凍結乾燥品です。
| 製品 | 生物種 | Size |
|---|---|---|
| Edit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNA Cherry-pick Library | Human, Mouse | glycerol Stock |
Edit-R Pooled Lentiviral sgRNA Library
Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAから選択されています。多数のターゲット遺伝子に対応した多種類のsgRNA発現用レンチウイルス粒子を混合したプール化sgRNAライブラリーは、DNAレベルで数百、数千の遺伝子をノックアウトする機能喪失スクリーニングを、NGSを用いることによって大規模なインフラを必要とせずに簡素化することができます。
- ヒトおよびマウスの各ゲノムにわたる遺伝子あたり5〜10のsgRNAを幅広く網羅し、ヒットの信頼性と包括的なゲノムスクリーニングを向上します。
- 使用する細胞に最適なEdit-RレンチウイルスCas9ヌクレアーゼ試薬と組み合わせて使用します。
- 製品形態はレンチウイルス粒子です。
各Edit-RレンチウイルスsgRNAプール化スクリーニングライブラリには以下が含まれます。
- 分注済みの5 x 10^ 8 TU / mL（±20％）のレンチウイルス粒子
- 8 x 25 µL（合計200 µL）：5000コンストラクト以下のライブラリーの場合
- 16 x 25 µL（合計400 µL）：5000コンストラクト以上のライブラリーの場合
- NCBI参照配列データベースの遺伝子を標的とする遺伝子あたり5〜10個のsgRNA
- ヒトおよびマウスのゲノム中のいかなる遺伝子もターゲットとしないことが生物情報学的に確認された100個のnon-targeting sgRNAネガティブコントロール。
- 最大34のタンパク質をコードする遺伝子（1遺伝子あたり10 sgRNA）を標的とする、最大340の遺伝子特異的sgRNAポジティブコントロール。共通のリファレンス遺伝子（ACTB、GAPDH、LAMB1、およびPPIB）を含みます。
- 遺伝子アノテーション、sgRNAターゲット配列、コントロールのリストなどのライブラリー情報を含むデータファイル
検証済みのプロトコールのために推奨される必要な試薬
- 形質導入最適化のためのベクター対応Edit-RレンチウイルスsgRNAノンターゲッティングコントロール
- それぞれ12種類のユニークなインデックスプライマーを含むEdit-R Pooled sgRNA Indexing PCR and Sequencing Primer Kit A/Bは、以下のための最適化されています。
- ゲノムDNAを鋳型としたsgRNA配列のPCR増幅
- ヒット識別のためのIlluminaフローセルを用いるハイスループット＆マルチプレックス次世代DNAシーケンス
| ヒト | マウス | |
|---|---|---|
| 製品 | 遺伝子数＊ | 遺伝子数＊ |
| Whole Genome | 18,525 | 19,683 |
| Druggable Genome | 7359 | 9827 |
| GPCR | 378 | 498 |
| Ion Channels | 345 | 340 |
| Protein Kinases | 700 | 708 |
| Phosphatases | 247 | 269 |
| Proteases | 473 | 533 |
| Ubiquitin Conjugation | 564 | 517 |
＊ 参照する遺伝子データベースにより予告なく変更になる場合があります。