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siRNA ライブラリー

siRNAライブラリーは、デザイン済みsiRNAをプレートに分注した製品です。各siRNAをそれぞれ細胞に導入し、表現型の変化を検出することで、生命現象のプロセスに関与する遺伝子を迅速に同定することができます。siRNAライブラリーを使ったsiRNAスクリーニングは、細胞内パスウェイの解析・遺伝子の機能解析・創薬ターゲット分子の探索などで活用されています。

特長

組み合わせ済コレクションライブラリーとCherry-pickカスタムライブラリーをご用意

遺伝子ファミリーおよびパスウェイごとに分類したコレクションをご用意しています。お客様のユニークな実験に対応するカスタムライブラリーは、Cherry-Pick Library Loaderで遺伝子名やリストをアップロードすることにより簡単にライブラリーを作成しオーダーすることができます。

製品情報

コレクションライブラリー

  • デザイン済みsiRNAをプレートに分注したライブラリー
  • 遺伝子ファミリーおよびパスウェイごとに分類したコレクションライブラリー
  • siGENOME、ON-TARGETplus、Accell、Lincode siRNAの4種類の製品ラインアップ
  • SMARTpoolあるいはSet of 4フォーマット

 

コレクションライブラリー(siGENOME、ON-TARGETplus、Accell)
Human    
コレクション siGENOME ON-TARGETplus Accell
Apoptosis 446 558
Cell cycle regulation 169 131
Cytokine receptors 116 116
Deubiquitinating enzymes 98 98
DNA damage response 240 240
Drug targets *1 ~4,700 ~4,700 ~4,700
Druggable genome *2 ~7,500 ~7,500 ~7,500
Epigenetics 463 463
G Protein-Coupled Receptors (GPCR) 390 390 390
Ion channels 349 349 347
Membrane trafficking 140 140
Nuclear receptors 52 52
Phosphatases 256 254 257
Proteases 480 478 480
Protein kinases 712 709 714
Serine Proteases 143
Transcription Factors 1,529
Tyrosine kinases 85 88
Ubiquitin conjugation subset #1 89 88 89
Ubiquitin conjugation subset #2 115 115 115
Ubiquitin conjugation subset #3 396 386 396
Whole genome ~18,000
Mouse    
コレクション siGENOME ON-TARGETplus Accell
Apoptosis 289 535
Cell cycle regulation 105 128
Cytokine receptors 158
Deubiquitinating enzymes 260 126
DNA damage response
Drug targets *1 ~7,100 ~5,100
Druggable genome *2 ~10,000 ~6,400
Epigenetics
G Protein-Coupled Receptors (GPCR) 515 571
Ion channels 340 335
Membrane trafficking 113
Nuclear receptors 46
Phosphatases 273 220
Proteases 540
Protein kinases 715 742 652
Serine Proteases 123
Transcription Factors 1,440
Tyrosine kinases 85
Ubiquitin conjugation subset #1 80 82
Ubiquitin conjugation subset #2 104 109
Ubiquitin conjugation subset #3 339 351
Whole genome ~19,000

※ 表中の数字は、各コレクションライブラリーに含まれるsiRNAターゲット遺伝子数を表します。参照データベースの変更等により、遺伝子数や製品構成は変更になる場合があります。

*1 アポトーシス、老化、DNA修復、オートファジー、核酸結合に関連する遺伝子や核内レセプター遺伝子などをターゲットとするsiRNAをまとめたコレクションです。

*2 Drug targetコレクションライブラリーに、GPCR、Ion channel、Phoshatase、Protease、Protein kinase、Ubiquitin conjugation subset #1~#3の8つのコレクションライブラリーをプラスした製品です(ただし、Mouse ON-TARGETplus Druggable genomeコレクションライブラリーは、 Drug targetコレクションライブラリーに、GPCRおよびProtein Kinaseの2つのコレクションライブラリーをプラスした製品です)。

コレクションライブラリー(Lincode)
製品 生物種 遺伝子数 フォーマット Size
Lincode siRNA Library –

NR lncRNA RefSeq v65

Human 3,430 SMARTpool / Set of 4 0.1, 0.25, 0.5 nmol
Lincode siRNA Library –

NR lncRNA RefSeq v65

Mouse 1,997 SMARTpool / Set of 4 0.1, 0.25, 0.5 nmol

※ NCBI RefSeqのバージョンおよびターゲット遺伝子数は変更になる場合があります。

Cherry-pick ライブラリー(siRNA)

  • お客さまのユニークな実験に対応するカスタムのsiRNAライブラリーを作成するサービスです。
  • Cherry-pick Library Loaderを使用して、ヒト・マウス遺伝子をターゲットとするデザイン済みsiRNAを、最少20ウェルから96ウェルプレートにレイアウトできます(384ウェルプレートの場合、最少40ウェルから)。
  • 小容量包装のため、コストを抑えたsiRNA実験が可能です。
  • 製品形態は凍結乾燥品です。

 

製品 製品タイプ 生物種 フォーマット Size
Cherry-pickライブラリー

(siRNA)

siGENOME,

ON-TARGETplus,

Accell,

Lincode

Human,

Mouse

SMARTpool,

1~4個のIndividual

0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol

スクリーニング実験の流れ

スクリーニング実験に先立ちアッセイ系の至適化を行います。1次スクリーニングでは、ターゲット遺伝子を確実にノックダウンできるSMARTpoolフォーマット製品が有用です。2次スクリーニングでは、SMARTpoolを使うと同時にSet of 4フォーマット製品を用いてヒットの検証を行います。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

関連リンク

【Dharmacon専用サイト】siRNA ライブラリー

Cherry-pick Library Loader

コントロールsiRNA

DharmaFECTトランスフェクション試薬

DharmaFECT 1~4は、細胞にあわせて最適条件で使い分ける4種類の低分子RNA(crRNA、tracrRNAを含む)用トランスフェクション試薬です。

バッファー・水・培地

各種資料 / 情報

siRNA/microRNA試薬再溶解プロトコル(プレート用)

Guidelines and Recommendations for Dharmacon siRNA Libraries(英語)