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カスタム siRNA

siRNAの配列を設計いただく際は、弊社のWebツールであるsiDESIGN Centerをご活用ください。ヒト・マウス・ラット以外の生物種の遺伝子や、特定の遺伝子バリアントをターゲットとするsiRNAの配列デザインに有用なツールです。お客様自身で配列デザインしたsiRNAや、各種修飾(蛍光標識やON-TARGETplus修飾、Accell修飾、in vivo導入用のsiSTABLE修飾)を導入したsiRNAの合成を承っています。詳しくは本社サイトのCustom siRNA Synthesis」にアクセスしてください。

特徴

  • 各種化学修飾(ON-TARGET、ON-TARGETplus、Accell、siSTABLE)を選択可能
  • 5’末端、3’末端にさまざまな修飾(下表)を導入可能
  • 合成後の処理は5種類のオプションから選択
  • 小容量(15 nmolスケール)から大容量までのカスタム合成に対応長鎖non-coding RNAをターゲットとするsiRNA

修飾

5‘修飾

5′-Amino modifier C12 5′-dA 5′-Fluorescein
5′-Amino modifier C3 5′-dC 5′-inverted deoxy-thymidine
5′-Amino modifier C5 5′-dG 5′-Phosphate
5′-Amino modifier C6 5′-dU 5′-Pyrene
5′-Biotin 5′-Dabcyl 5′-TET(Tetrachloro-fluorescein)
5′-Cholesterol 5′-Disulfide Thiol-Modifier 5′-TAMRA (Carboxytetramethylrhodamine)
5′-Cy3 5′-DY547(Cy3 alternate)
5′-Cy5 5′-DY677(Cy5.5 alternate)
5′-Cy5.5

3‘修飾

3′-Biotin 3′-Cy3 3′-Amino modifier C12
3′-Cholesterol 3′-Cy5 3′-Amino modifier C6
3′-dG 3′-Cy5.5 3′-Amino modifier C3
3′-Fluorescein 3′-DY547 (Cy3 alternate) 3′-Puromycin
3′-TAMRA (Carboxytetramethylrhodamine) 3′ Inverted deoxy-thymidine 3′-Disulfide-thiol modifier

※ その他の修飾基については本社ウェブサイトの「Custom siRNA Synthesis」をご覧ください。

 

合成後の処理オプション

Single Strands

(A1)

Standard HPLC in vivo in vivo HPLC
エタノール沈殿あるいは逆相カラムによる脱塩処理
RNAは2′-ACE保護基を除去した状態
アニーリング(2本のRNAがアニーリングされ2本鎖になっています)
精製
エンドトキシンテスト
カウンターイオン交換(Na+)
RNAは2′-ACE保護基の付いた状態
RNAはセンス鎖とアンチセンス鎖を別々のチューブで提供

 

イオン交換HPLCにより精製しています。

 

関連リンク

【本社サイト】カスタムsiRNA合成

【本社サイト】siDESIGNセンター