MENU
Horizon本社サイトへ Dharmaconサイトへ
お問い合わせ
Dharmacon™ Edit-R™ CRISPR-Cas9ゲノム編集試薬
CRISPRスクリーニングライブラリー

プール化(pooled)sgRNAまたはアレイ化(arrayed)crRNAによってハイスループットゲノム編集実験が可能となります。

アレイ化(arrayed)crRNAは、マルチパラメーターの表現型解析、ハイコンテント表現型解析や形態学的またはレポーターアッセイなどを含むシングルウェルで行う様々な表現型アッセイを可能にします。

機能喪失スクリーニングは、遺伝子機能および相互作用を発見するための強力な前向き遺伝的アプローチです。多数のターゲット遺伝子に対応した多種類のsgRNA発現用レンチウイルス粒子を混合したプール化sgRNAライブラリーは、DNAレベルで数百、数千の遺伝子をノックアウトする機能喪失スクリーニングを、NGSを用いることによって大規模なインフラを必要とせずに簡素化しました。

特長

豊富な組み合わせ済ライブラリーとカスタムライブラリー

遺伝子ファミリー全体、Druggable、または生物学的パスウェイ研究用の組み合わせ済ライブラリーをご用意しています。カスタムライブラリーはCherry-Pick Library Loaderで遺伝子名やリストをアップロードすることにより簡単にライブラリーを作成しオーダーすることができます。

遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いCRISPR-Cas9ライブラリー

アレイ化およびプール化ライブラリーはいずれも、Horizonのアルゴリズム(Edit-R algorithm)による遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みガイドRNAでライブラリー化されています。

製品情報

Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Library

より堅牢で信頼性の高い遺伝子ノックアウトのために、Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) crRNA(化学合成品)から選択されています。アレイ化ライブラリーフォーマットは、ハイコンテント表現型解析や形態学的またはレポーターアッセイなど、シングルウェルで行う様々な表現型アッセイを可能にします。

  • ヒト・マウス用のデザイン済みcrRNAを、遺伝子ファミリーやパスウェイごとに分類して96あるいは384ウェルプレートに分注した製品です。
  • 遺伝子あたり4種類のデザイン済みcrRNAを混合したPoolフォーマットと、4種類をセットにしたSet of 4フォーマットをご用意しています。
  • 包装容量は0.1、0.25、0.5 nmol から選択可能です。
  • 製品形態は凍結乾燥品です。

 

ヒト

マウス

製品

遺伝子数*1

遺伝子数*1

Edit-R – Cell Cycle Regulation

169

105

Edit-R – Cytokine Receptors

110

139

Edit-R – Deubiquitinating Enzymes

94

100

Edit-R – DNA Damage Response

240

Edit-R – Drug Targets

3,686

Edit-R – Druggable Genome*2

8,422

Edit-R – Epigenetics

835

724

Edit-R – G Protein-coupled Receptors

390

515

Edit-R – Genome

19,127

Edit-R – Ion channels

417

340

Edit-R – Membrane Trafficking

140

113

Edit-R – Nuclear Receptors

52

46

Edit-R – Phosphatases

248

273

Edit-R – Proteases

527

599

Edit-R – Protein Kinases

746

774

Edit-R – Transcription Factors

1,580

1,419

Edit-R – Tyrosine Kinases

90

92

Edit-R – Ubiquitin Enzymes

738

752

*1 参照するデータベースにより予告なく変更になる場合があります。

*2 Proteases、Protein Kinases、Phosphatases、Transcription Factors、Ubiquitin Enzymes、GPCRs、Ion Channels、Drug Target各ライブラリーをセットとした製品です。

Cherry-Pick CRISPR (knockout) crRNA Library

お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) crRNAを、96あるいは384ウェルプレートに分注してお届けするサービスです。

  • Cherry-pick Library Loaderは、お客様独自の実験ニーズに合わせてフレキシブルにライブラリーを選択し、プレートレイアウトをカスタマイズできます。
  • ご希望のウェルにコントロールを追加できます。
  • 遺伝子あたり4種類のデザイン済みcrRNAを混合したPoolフォーマットと、1配列毎に分注したIndividualフォーマットがあります。Individualフォーマットは1遺伝子につき1~5配列から選択できます。
  • 最低注文数:20ウェル分の製品(96ウェルプレートの場合)、40ウェル分の製品(384ウェルプレートの場合)
  • 製品形態は凍結乾燥品です。

 

製品

生物種

Size

Pool: Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Cherry-pick Library

(4配列の混合物/ウェル)

Human,
Mouse

0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol

(1 poolあたり)

Individual: Edit-R CRISPR (knockout) crRNA Cherry-pick Library(1配列/ウェル)

0.1, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 nmol

(1 配列あたり)

Edit-R Arrayed Lentiviral sgRNA Library

  • Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) sgRNAから選択されています。
  • デザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAベクターを導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えた溶液を、遺伝子ファミリーやパスウェイごとに分類して96ウェルプレートに分注した製品です。
  • 遺伝子あたり4種類のデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAをご用意しています。
  • ヒト用のみです。

 

ヒト

製品

遺伝子数

Edit-R – Druggable Genome

7,826

Edit-R – Drug Targets

3,737

Edit-R – G Protein-coupled Receptors

381

Edit-R – Ion channels

348

Edit-R – Phosphatases

253

Edit-R – Proteases

478

Edit-R – Protein Kinases

698

Edit-R – Transcription Factors

1,507

Edit-R – Ubiquitin Conjugation

583

参照する遺伝子データベースにより予告なく変更になる場合があります。

Cherry-Pick CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNA Clone Library

お客様が選択した遺伝子に対するデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAベクター導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えた溶液を、96ウェルプレートに分注してお届けするサービスです。

  • Cherry-pick Library Loaderは、お客様独自の実験ニーズに合わせてフレキシブルにライブラリーを選択し、プレートレイアウトをカスタマイズできます。
  • ご希望のウェルにコントロールを追加できます。
  • 最低注文数:20ウェル分の製品
  • 製品形態は凍結乾燥品です。

 

製品

生物種

Size

Edit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNA Cherry-pick Library

Human, Mouse

glycerol Stock

Edit-R Pooled Lentiviral sgRNA Library

Edit-R algorithmによる遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNAから選択されています。多数のターゲット遺伝子に対応した多種類のsgRNA発現用レンチウイルス粒子を混合したプール化sgRNAライブラリーは、DNAレベルで数百、数千の遺伝子をノックアウトする機能喪失スクリーニングを、NGSを用いることによって大規模なインフラを必要とせずに簡素化することができます。

  • ヒト、マウス、ラットの各ゲノムにわたる遺伝子あたり5〜10のsgRNAを幅広く網羅し、ヒットの信頼性と包括的なゲノムスクリーニングを向上します。
  • 使用する細胞に最適なEdit-RレンチウイルスCas9ヌクレアーゼ試薬と組み合わせて使用します。
  • 製品形態はレンチウイルス粒子です。

 

各Edit-RレンチウイルスsgRNAプール化スクリーニングライブラリには以下が含まれます。

  • 分注済みの5 x 10^ 8 TU / mL(±20%)のレンチウイルス粒子
  • 8 x 25 µL(合計200 µL):5000コンストラクト以下のライブラリーの場合
  • 16 x 25 µL(合計400 µL):5000コンストラクト以上のライブラリーの場合
  • NCBI参照配列データベースの遺伝子を標的とする遺伝子あたり5〜10個のsgRNA
  • ヒト、マウスおよびラットのゲノム中のいかなる遺伝子もターゲットとしないことが生物情報学的に確認された100個のnon-targeting sgRNAネガティブコントロール。
  • 最大34のタンパク質をコードする遺伝子(1遺伝子あたり10 sgRNA)を標的とする、最大340の遺伝子特異的sgRNAポジティブコントロール。共通のリファレンス遺伝子(ACTB、GAPDH、LAMB1、およびPPIB)を含みます。
  • 遺伝子アノテーション、sgRNAターゲット配列、コントロールのリストなどのライブラリー情報を含むデータファイル

 

検証済みのプロトコールのために推奨される必要な試薬

  • 形質導入最適化のためのベクター対応Edit-RレンチウイルスsgRNAノンターゲッティングコントロール
  • それぞれ12種類のユニークなインデックスプライマーを含むEdit-R Pooled sgRNA Indexing PCR and Sequencing Primer Kit A/Bは、以下のための最適化されています。
    • ゲノムDNAを鋳型としたsgRNA配列のPCR増幅
    • ヒット識別のためのIlluminaフローセルを用いるハイスループット&マルチプレックス次世代DNAシーケンス

 

ヒト

マウス

製品

遺伝子数

遺伝子数

Whole Genome

18,525

19,683

Druggable Genome

7359

9827

GPCR

378

498

Ion Channels

345

340

Protein Kinases

700

708

Phosphatases

247

269

Proteases

473

533

Ubiquitin Conjugation

564

517

参照する遺伝子データベースにより予告なく変更になる場合があります。

関連リンク

【Dharmacon専用サイト】CRISPRスクリーニングライブラリー

Cherry-pick Library Loader

DharmaFECTトランスフェクション試薬

DharmaFECT 1~4は、細胞にあわせて最適条件で使い分ける4種類の低分子RNA(crRNA、tracrRNAを含む)用トランスフェクション試薬です。

バッファー・水・培地

機能的ゲノミクススクリーニング

各種資料 / 情報

ハイコンテント分析スクリーニング実験におけるプール化した化学合成crRNAの有効性(英語)