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Edit-R CRISPR-Cas9ゲノム編集試薬
遺伝子ノックアウト用ガイドRNA

ガイドRNAは、特定のゲノム位置で切断するためにCas9ヌクレアーゼをリクルートします。効果的で機能的なガイドRNAのデザインは効率的な遺伝子ノックアウトを達成するために重要です。

特長

弊社独自の配列デザインアルゴリズム (Edit-R algorithm)

遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いガイドRNAが設計できるように、複数のアッセイで検証した独自のアルゴリズムを開発しました。

Edit-R algorithmは、単なる二本鎖DNA切断ではなく機能的な遺伝子ノックアウトを引き起こすガイドRNAを設計するために開発されました。また、本アルゴリズムのアラインメントツールはミスマッチやギャップを確実に検出・除去するため、オフターゲットを最少限に抑制します。

デザイン済みガイドRNA

高いRNA合成技術力とEdit-R algorithmによって、ヒト・マウス・ラット遺伝子をほぼ完全に網羅した、遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いデザイン済みガイドRNAをご用意しています。

2種類のガイドRNAから選択可能

CRISPR RNA(crRNA)と trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA) のハイブリッドを用いる方法、およびシングルガイドRNA(single guide RNA: sgRNA)を用いる方法をご用意しています。

製品情報

デザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) crRNA

Edit-R crRNAは、ゲノムDNAターゲット部位と同一の20塩基からなる配列の3’末端に、S. pyogenes由来の反復配列(tracrRNAとの結合に必要)を付加した化学合成RNAです。遺伝子の選択された20塩基のターゲット配列は、ゲノムDNA中のプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)のすぐ上流にある必要があります。

  • 遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いcrRNA配列が遺伝子ごとに最大5個デザインされています。
  • ヌクレアーゼ耐性修飾が導入されています。
  • Edit-R tracrRNAと組み合わせて使用します。
  • 製品形態は凍結乾燥品です。
製品 生物種 Size
Edit-R Synthetic crRNA Human, Mouse, Rat 2, 5, 10, 20 nmol

 

Edit-R tracrRNA

Edit-R tracrRNAは、Cas 9ヌクレアーゼをリクルートして複合体を形成するためにEdit-R crRNAと共に使用する際に必要です。

  • 公開されているStreptococcus pyogenes のtracrRNA配列を元にした配列を合成後にHPLCで精製した化学合成品です。
  • ヌクレアーゼ耐性修飾が導入されています。
  • 複数の哺乳動物細胞において効率的なゲノム編集を実現することを確認しています。
  • 製品形態は凍結乾燥品です。
製品 生物種 Size
Edit-R CRISPR-Cas9 Synthetic tracrRNA

Human, Mouse, Rat

2, 5, 10, 20 nmol

 

デザイン済みEdit-R CRISPR (knockout) Lentiviral sgRNA

Edit-RレンチウイルスsgRNAは、短いリンカーを介して融合したcrRNAおよびtracrRNAからなるキメラ構造(sgRNA)を発現します。Edit-RレンチウイルスsgRNAベクターバックボーンでは、ヒトU6プロモーターの制御下で遺伝子特異的sgRNAが発現され、mCMVプロモーターによりピューロマイシン耐性マーカー(PuroR)が発現し、sgRNAが導入された細胞の迅速なセレクションが可能になります。

  • 遺伝子ノックアウト効率と特異性の高いsgRNA配列が遺伝子ごとに最大10個デザインされています。
  • 初代培養細胞や神経細胞といったトランスフェクションの困難な細胞を用いてゲノム編集を行う場合に最適です。
  • 製品形態は、レンチウイルス粒子あるいは大腸菌グリセロールストックです。精製された濃縮レンチウイルス粒子は、精製物中の毒性のあるデブリや夾雑物なしに、トランスフェクトが困難な細胞に直接形質導入することができます。グリセロールストックは、大腸菌を増殖させ、調製した発現プラスミドをトランスフェクションまたはウイルスパッケージングのために使用することができます。

 

製品 生物種 プロモーター Size
Edit-R Lentiviral sgRNA Human,

Mouse,

Rat

mCMV 100 µL, 10^8 TU/mL
200 µL, 10^8 TU/mL
glycerol stock*2
Edit-R Set of 3 Lentiviral sgRNA*1 100 µL, 10^8 TU/mL x 3
200 µL, 10^8 TU/mL x 3
glycerol stock x 3*2

*1 お好みのデザイン済みsgRNA発現用レンチウイルスを3つセットでご提供する製品です。

*2 sgRNAを発現するレンチウイルスベクターを導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えたものです。レンチウイルスベクターのパッケージングにはTrans-Lentiviral Packaging Kit がおすすめです。

関連リンク

【本社サイト】遺伝子ノックアウト用ガイドRNA

CRISPR Design Tool

お客様自身でcrRNAあるいはsgRNAを設計・注文いただくWebツールです。

Cas9ヌクレアーゼ

Edit-R HDR Donor Designer

DharmaFECTトランスフェクション試薬

DharmaFECT 1~4は、細胞にあわせて最適条件で使い分ける4種類の低分子RNA(crRNA、tracrRNAを含む)用トランスフェクション試薬です。

バッファー・水・細胞培養液

各種資料 / 情報

Edit-R CRISPR-Cas9 ゲノム編集試薬マニュアル