転写活性化用ガイドRNA
ガイドRNAはCRISPRaシステムの重要な要素です。Dharmacon Edit-R CRISPRaガイドRNAは、Horlbeckらによって開発されたアルゴリズムであらかじめデザインされています。Horlbeckらは、CRISPRa活性に寄与する特徴を同定するために、転写開始部位（TSS）に隣接するプロトスペーサー隣接モチーフ（PAM）部位の系統的研究を行いました。化学合成タイプのcrRNAとレンチウイルスベクタータイプのsgRNA製品をラインアップし、それぞれ転写活性化能の高いガイドRNA配列が、遺伝子ごとに4種類デザインされています。
特長
dCas9-VPRシステムを用いた転写活性化用ガイドRNA
VPRシステムは、dCas9-VPRとガイドRNAの2つのコンポネントだけでターゲット遺伝子を転写活性化させます。
転写活性化能の高いガイドRNA配列を遺伝子ごとに4個デザイン済み
Horlbeck等の開発した配列デザインアルゴリズムにより、転写活性化能の高いcrRNA配列が遺伝子ごとに4個デザインされており、使いやすいフォーマットをご用意しています。
製品情報
デザイン済みEdit-R CRISPRa（activation）crRNA
ヒト・マウス遺伝子をほぼ完全に網羅したデザイン済みcrRNA（化学合成品）です。
- Horlbeck等の開発した配列デザインアルゴリズムにより、転写活性化能の高いcrRNA配列が遺伝子ごとに4個デザインされています。
- 4個のcrRNAを混合して1本のチューブにまとめたpoolフォーマット、4個のcrRNAを4本のチューブに個別に入れてセットとしたSet of 4フォーマット、4個のcrRNAを個別としたindividual フォーマットをご用意しています。
- ヌクレアーゼ耐性修飾が導入されています。
- 製品形態は凍結乾燥品です。Edit-R tracrRNA と組み合わせて使用します。
| 製品 | 生物種 | Size |
|---|---|---|
| Edit-R CRISPRa crRNA | Human, Mouse |
2, 5, 10, 20 nmol |
| Edit-R CRISPRa Set of 4 crRNA | 2, 5, 10, 20 nmol x 4 | |
| Edit-R CRISPRa crRNA pool | 5, 10, 20 nmol |
Edit-R tracrRNA
Edit-R tracrRNAは、Cas 9ヌクレアーゼをリクルートして複合体を形成するためにEdit-R CRISPRa crRNAと共に使用する際に必要です。
- 公開されているStreptococcus pyogenes のtracrRNA配列を元にした配列を合成後にHPLCで精製した化学合成品です。
- ヌクレアーゼ耐性修飾が導入されています。
- 複数の哺乳動物細胞において効率的なゲノム編集を実現することを確認しています。
- 製品形態は凍結乾燥品です。
| 製品 | 生物種 | Size |
|---|---|---|
| Edit-R CRISPR-Cas9 Synthetic tracrRNA | Human, Mouse, Rat | 2, 5, 10, 20 nmol |
デザイン済みEdit-R CRISPRa (activation) Lentiviral sgRNA
ヒト・マウス遺伝子をほぼ完全に網羅したデザイン済みsgRNA発現用レンチウイルスベクターです。
- Horlbeck等の開発した配列デザインアルゴリズムにより、転写活性化能の高いsgRNA配列が遺伝子ごとに4個デザインされています。
- 4個のsgRNAを4本のチューブに個別に入れてセットとしたSet of 4フォーマット、4個のsgRNAを個別としたindividual フォーマットをご用意しています。
- 製品形態は、レンチウイルス粒子あるいは大腸菌グリセロールストックです。
| 製品 | 生物種 | プロモーター | Size |
|---|---|---|---|
| Edit-R CRISPRa Lentiviral sgRNA | Human, Mouse |
mCMV | 100 µL, 10^8 TU/mL |
| 200 µL, 10^8 TU/mL | |||
| glycerol stock＊ | |||
| Edit-R CRISPRa Set of 4 Lentiviral sgRNA | 100 µL, 10^8 TU/mL x 4 | ||
| 200 µL, 10^8 TU/mL x 4 | |||
| glycerol stock x 4＊ |
＊ sgRNAを発現するレンチウイルスベクターを導入した大腸菌の培養液にグリセロールを加えたものです。レンチウイルスベクターのパッケージングにはTrans-Lentiviral Packaging Kit がおすすめです。